39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2705 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  31.03 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  42.11 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  37.08 
 
 
292 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  38.71 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.47 
 
 
147 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  31.25 
 
 
177 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  32.41 
 
 
355 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  30.89 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  31.07 
 
 
391 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  31.07 
 
 
391 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  37.66 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  27.91 
 
 
376 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  36.19 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  33.12 
 
 
383 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0183  hypothetical protein  36.96 
 
 
252 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 
272 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.88 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  26.17 
 
 
372 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  31.29 
 
 
351 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  35.78 
 
 
286 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  32 
 
 
266 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  32.61 
 
 
372 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  30.7 
 
 
352 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  35.11 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.04 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  35.16 
 
 
289 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  32.28 
 
 
425 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
270 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  31.5 
 
 
350 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 
399 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.37 
 
 
354 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
160 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  27.66 
 
 
357 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.11 
 
 
283 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  29.59 
 
 
289 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>