67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2003 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  32.95 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.75 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  31.87 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  31.87 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  26.85 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  30.59 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  26.46 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  23.84 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  28.16 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  27.38 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.28 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.74 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  31.32 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.46 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  31.54 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7697  hypothetical protein  28.78 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  34.31 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.18 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.09 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  24.71 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  28.68 
 
 		 173 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.28 
 
 		 386 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.82 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25.14 
 
 		 399 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.08 
 
 		 175 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  30.65 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  28.69 
 
 		 173 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  23.83 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  29.57 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  26.46 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.81 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 400 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  36 
 
 		 216 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  26.2 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  36.49 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  36.49 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  26.2 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  31.13 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.24 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  28.97 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  22.34 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  27.52 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.24 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  35.78 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.75 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  25.79 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32.54 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  28.38 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  28.19 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  23.78 
 
 		 367 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.31 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.24 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 396 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  30.94 
 
 		 169 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>