51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2671 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  54.25 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  35.44 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  30.59 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.58 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  28.44 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  30.13 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  30.13 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  29.44 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  34.35 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.82 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.61 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  23.49 
 
 		 410 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  29.69 
 
 		 366 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  26.62 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  28.33 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 367 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  32.1 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  29.6 
 
 		 359 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.79 
 
 		 367 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.16 
 
 		 399 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  31.19 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.71 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  24.85 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  29.58 
 
 		 375 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.53 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 387 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  32.54 
 
 		 362 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.33 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  23.74 
 
 		 357 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  26.71 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  22.11 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  29.45 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  33.6 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0593  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  24.21 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  31.2 
 
 		 392 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  29.46 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  29.46 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.2 
 
 		 173 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  26.92 
 
 		 350 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.29 
 
 		 347 aa  42  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>