56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1805 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 396 aa  800    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  32.38 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  33.42 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  32.82 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  27.94 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  24.66 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  25.08 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  24.67 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  24.23 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  25.08 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  26.01 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  26.21 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  24.24 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  26.34 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.94 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.47 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.47 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  28.96 
 
 		 173 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  22.62 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  21.77 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  23.99 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  24.26 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  26.35 
 
 		 349 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  27.34 
 
 		 257 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  24.04 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  25.25 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  24.24 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  24.01 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  26.32 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 106 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  25.93 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 112 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.89 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  28.83 
 
 		 122 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  26.99 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  23.86 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  27.12 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  32.86 
 
 		 196 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  24.8 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>