80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2248 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  722    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  71.99 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  47.19 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.07 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  30.4 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  28.73 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  26.7 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  26.86 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  25.72 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  25.26 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.03 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  36.3 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  36.3 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.24 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  26.36 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  26.69 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  35.58 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  33.11 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  24.44 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  24.9 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  24.44 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  31.08 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  29.63 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  24.03 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.67 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  32.61 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  35 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  32.1 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  27.35 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  27.11 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  35.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  35.64 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  25.54 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  22.5 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.51 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  28.18 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  28.18 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  34.26 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  28.18 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30.28 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  35.35 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.89 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.38 
 
 		 266 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  30 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  25.54 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.16 
 
 		 147 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  31 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  34.41 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.03 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.7 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  28.68 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.95 
 
 		 175 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  24.55 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  31.85 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32.41 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  31.75 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  31.75 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  39.36 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  39.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  39.44 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  39.44 
 
 		 216 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  32.97 
 
 		 169 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  23.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  23.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  32.04 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>