64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1489 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 388 aa  797    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  38.21 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  23.51 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  27.23 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  22.16 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  23.16 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  25.41 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  24.5 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  25.44 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.81 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  22.27 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  26.33 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  21.28 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.04 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  22.01 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  26 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.44 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  23.02 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  27.38 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 125 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.55 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  22.09 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  26.3 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  22.07 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  23.38 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  21.14 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  24.58 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  26.63 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  23.75 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  23.18 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  31.79 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  22.73 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  31.79 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  20.19 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  22.53 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  27.5 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  32.8 
 
 		 147 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  27.13 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  29.91 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  20.12 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  27.48 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  31.08 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1853  hypothetical protein  27.69 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.163672  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  19.64 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  20.72 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  23.91 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  27.43 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  22.31 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  22.22 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  19.88 
 
 		 351 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  20.72 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  26.17 
 
 		 188 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  19.64 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  21.9 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.67 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 118 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  24.24 
 
 		 182 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>