258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1391 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  49.39 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  43.66 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  43.36 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  39.82 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  41.62 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  39.36 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  39.3 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  34.93 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.06 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  28.66 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.89 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  25.53 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  29.9 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  29.89 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  29.49 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.44 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  30.82 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  29.41 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.44 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  30.7 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.39 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  29.61 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.27 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.27 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.52 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  29.07 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  28.3 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.38 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  26.97 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.97 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.25 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.03 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  25.89 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.46 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.88 
 
 		 395 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.81 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  27.6 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  26.23 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  28.01 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  28.32 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  27.67 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.16 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  23.59 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  26.96 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  26.83 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.51 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  29.08 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  26.76 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  30.4 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  30.86 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  47.37 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  24.24 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  28 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  25.99 
 
 		 174 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  25.64 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  27.8 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  31.5 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  31.5 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  31.5 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 92 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 133 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  27.12 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  25.44 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 115 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 115 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  28.95 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  34.43 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 128 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 175 aa  50.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.34 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  21.27 
 
 		 472 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 489 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.93 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  25.1 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 123 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.94 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>