206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0234 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  677    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  29.84 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.54 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 262 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 262 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.54 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  47.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  47.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  47.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  47.56 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  47.56 
 
 		 92 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  47.56 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  48.72 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  46.27 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  46.97 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  25.61 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  46.77 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 115 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 142 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 111 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 145 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  52.8  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  36 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  36.84 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 127 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 109 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  37.5 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 104 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.98 
 
 		 114 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  34.26 
 
 		 114 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  38.98 
 
 		 114 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  36.76 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  36.76 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 115 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 115 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  35.06 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.88 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 123 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  37.93 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  47.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>