76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3160 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 404 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  39.12 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  39.66 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.31 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  37.35 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  32.94 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  31.62 
 
 		 383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  34.6 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  42.63 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  37.16 
 
 		 372 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  34.66 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  30.85 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.44 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  31.59 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  29.46 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  31.91 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  29.24 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25.32 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  32.14 
 
 		 350 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  30.83 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  31.85 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  31.87 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  32.49 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  31.66 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  31.61 
 
 		 367 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  28.48 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  26.05 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  26.05 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  30.7 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.46 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.3 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  30.59 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.8 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  26.91 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  27.09 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  26.33 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  25.98 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  28.62 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  28.62 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  28.62 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.14 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  22.4 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  26.46 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.9 
 
 		 156 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  27.58 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.58 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  30.64 
 
 		 173 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  29.28 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  26 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.36 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  26.88 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.21 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  41.38 
 
 		 181 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  28.08 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.41 
 
 		 182 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  36.17 
 
 		 169 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2304  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2300  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2296  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2292  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 115 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  28.92 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>