More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  67.84 
 
 		 513 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  66.38 
 
 		 488 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  100 
 
 		 489 aa  977    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  70.42 
 
 		 486 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  52.09 
 
 		 495 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  52.74 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  54.6 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  53.18 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  52.65 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  50.84 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  51.27 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  52.63 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  50.63 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  50.21 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  25.8 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  25.61 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 227 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 227 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 105 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 107 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 189 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 252 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  23.59 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  49.12 
 
 		 182 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 232 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  32.12 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  35.37 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  27.3 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 178 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 187 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 186 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  35.79 
 
 		 215 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 198 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  34.15 
 
 		 107 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  43.33 
 
 		 72 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 210 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  35.37 
 
 		 107 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 201 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 210 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 191 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 201 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 186 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 186 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 186 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 186 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 201 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 201 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 171 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 210 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  39.34 
 
 		 107 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 199 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 191 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 186 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 197 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 184 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  21.89 
 
 		 511 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 107 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  34.86 
 
 		 117 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  22.44 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 195 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  22.22 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  40 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 97 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 207 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  34.15 
 
 		 107 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>