144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3964 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  51.97 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  51.97 
 
 		 237 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  44.44 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  43.65 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  47.76 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  46.03 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  41.11 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  41.8 
 
 		 243 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  43.87 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  43.87 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  42.29 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  42.69 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  43.87 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  43.48 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  43.98 
 
 		 225 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  42.29 
 
 		 240 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  47.29 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  41.9 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  39.76 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  36.4 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  35.52 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  48.67 
 
 		 218 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.59 
 
 		 243 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  38.85 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  30.95 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  30.86 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.05 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.77 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  49.47 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.8 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 215 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.79 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  28.02 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.74 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.74 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  28.94 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  25.97 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.83 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  30.7 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.84 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  24.52 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  33.55 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.13 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.06 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28.1 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  26.46 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  32.69 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.41 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.09 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.52 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.42 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.64 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.86 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  36.88 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.62 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  35.25 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  45.59 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  31.58 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.96 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.06 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  33.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.03 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.17 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  36.62 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.67 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.4 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  47.37 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  24.8 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  45.07 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  24.9 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.24 
 
 		 206 aa  52.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  33.05 
 
 		 124 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  37.7 
 
 		 71 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  24.6 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  24.7 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  38.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  23.6 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  31.65 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  30.43 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  22.09 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  31.72 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  32.17 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  30.14 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  30.14 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  44.44 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  26.89 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>