More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1603 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  100 
 
 		 347 aa  707    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  42.51 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  36.31 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 367 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  36.73 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  33.53 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  34.5 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  29.94 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  26.5 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.18 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  27.48 
 
 		 399 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  27.14 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.35 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  25.56 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  27.04 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.59 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  27.78 
 
 		 365 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  25.99 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.61 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  27.03 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  27.09 
 
 		 404 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  25.58 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  29.14 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  29.72 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  26.67 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  26.69 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.28 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  26.06 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  26.21 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  23.96 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  25.42 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  23.25 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  24.23 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  27.96 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  25.18 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  24.44 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  24.44 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  23.4 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  27.42 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  22.67 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  45.9 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  26.47 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  23.68 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  24.25 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 84 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 118 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.41 
 
 		 122 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.41 
 
 		 122 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.12 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.5 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 115 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.95 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.41 
 
 		 122 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  24.07 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 123 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  43.86 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 114 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  34.13 
 
 		 171 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 262 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 115 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  24.19 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  33.65 
 
 		 109 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 92 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 114 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 113 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 198 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  32.38 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>