226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2410 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 248 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  38.46 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  36.11 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.33 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  34.52 
 
 		 359 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  35 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 122 aa  43.9  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 81 aa  43.9  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  36.76 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3830  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0176274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4125  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.893479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 503 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4027  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.571082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  47.62 
 
 		 206 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  24.24 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4172  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00033088  normal  0.222427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  31.82 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.87 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>