81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2215 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  32.91 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  29.87 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  27.95 
 
 		 283 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  34.65 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  28.1 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  29.68 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  32.1 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  32.37 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  32.35 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  26.9 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  31.91 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  27.44 
 
 		 296 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  38.46 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.33 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  33.09 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  29.87 
 
 		 248 aa  52  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  32 
 
 		 224 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  32 
 
 		 224 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  39.8 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  28.05 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.85 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.85 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  34.13 
 
 		 347 aa  50.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  36 
 
 		 285 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 1180 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.91 
 
 		 362 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  29.19 
 
 		 257 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  28.08 
 
 		 302 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  30.58 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  26.8 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  32.56 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  29.45 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  26.8 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 		 1177 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  37.86 
 
 		 425 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  26.06 
 
 		 347 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  25.77 
 
 		 289 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 352 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  28.93 
 
 		 261 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  40.62 
 
 		 292 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  27.62 
 
 		 393 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.92 
 
 		 251 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  35.87 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5400  hypothetical protein  34.58 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  38.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  35.29 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  26.63 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2995  hypothetical protein  27.1 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  32.54 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  38.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  38.1 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  43.21 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  31.07 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  29.38 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  43.21 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  35.16 
 
 		 394 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  34.52 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  30.28 
 
 		 395 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 346 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  33.71 
 
 		 181 aa  42  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  26.87 
 
 		 399 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3673  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  30.25 
 
 		 327 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  40.24 
 
 		 365 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  28.26 
 
 		 367 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2128  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.607652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  27.85 
 
 		 235 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  27.88 
 
 		 294 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  27.05 
 
 		 355 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  33.04 
 
 		 385 aa  40.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  29.51 
 
 		 352 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>