More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1627 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.83 
 
 		 256 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  32.37 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  46.77 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 107 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  43.94 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  45.45 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  45.45 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  45.45 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 181 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  25.57 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.1 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  35.37 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  38.3 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0927  XRE family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 469 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 433 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 189 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  39.13 
 
 		 474 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 77 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 130 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 104 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 128 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 105 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 181 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>