109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4724 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  957    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  47.67 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  48.63 
 
 		 470 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  48.94 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  47.36 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 469 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  49.05 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  49.26 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 464 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  48 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  44.49 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  42.02 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  41.18 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  41.81 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  41.16 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  40.97 
 
 		 475 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  39.83 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  40.25 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.96 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  43.22 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  39.57 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 474 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  40.25 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  40.64 
 
 		 475 aa  335  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 482 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  40.08 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 490 aa  326  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.42 
 
 		 484 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  41.01 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  39.83 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  39.54 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  38.76 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  38.54 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 477 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  38.51 
 
 		 476 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  39.78 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 461 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 479 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  34.96 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  35.96 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  33.62 
 
 		 483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  33.19 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  36.44 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 491 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 462 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  21.69 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.59 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  24.88 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  20.77 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  18.96 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  23.11 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3499  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 712 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2163  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 710 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 101 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  32.56 
 
 		 179 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>