More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2259 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 255 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  73.73 
 
 		 255 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  59.45 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  55.74 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  54.72 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  45.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 83 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 181 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  35.87 
 
 		 181 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 101 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  23.08 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  43.55 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 77 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 110 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  41.27 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 89 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.9 
 
 		 72 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 91 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 528 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.79 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  41.18 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 90 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 171 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 107 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 91 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 130 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 199 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  22.53 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 181 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 94 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  42.86 
 
 		 107 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  42.86 
 
 		 107 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 105 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>