More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2927 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 130 aa  257  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  81.54 
 
 		 130 aa  218  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 140 aa  193  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  40.7 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.62 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 505 aa  53.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 255 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0046  conjugal transfer protein TrbA  38.67 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  36.56 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 230 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 505 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2264  conjugal transfer protein TrbA  42.11 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000287063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  45 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4275  conjugal transfer protein TrbA  35.19 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  6.75879e-22  normal  0.733184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6501  conjugal transfer protein TrbA  35.19 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6591  conjugal transfer protein TrbA  35.19 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000102889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  32.86 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  32.86 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 202 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>