221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6981 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3612  putative prophage repressor  41.31 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  40.83 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  45.27 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0210  putative prophage repressor  31.46 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2499  transcriptional regulator, XRE family  30.7 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5087  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 124 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  38.67 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 105 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  48.21 
 
 		 72 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1543  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  25.93 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 130 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.07 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 140 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 77 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 390 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  49.12 
 
 		 489 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 195 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 82 aa  48.9  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  35.48 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 75 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  43.86 
 
 		 488 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 86 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 112 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  36.92 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0046  conjugal transfer protein TrbA  36.9 
 
 		 122 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  37.29 
 
 		 86 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 69 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 105 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.85 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.76 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 120 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  27.52 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  27.52 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 130 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 182 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  33.87 
 
 		 75 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  41.94 
 
 		 155 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 120 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 197 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>