188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2780 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 152 aa  303  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  39.47 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.94 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.42 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  41.51 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.59 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 103 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.11 
 
 		 368 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 69 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  35.19 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2581  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321044  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  24.58 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>