200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2733 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  44.86 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.17 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.17 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2922  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0442  hypothetical protein  42.11 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00012012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  31.11 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4828  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1577  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 374 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  37.5 
 
 		 263 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 380 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.47 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.47 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.47 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 244 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  30.63 
 
 		 312 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 410 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0343  putative HTH-type transcriptional regulator  33.82 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0062  hypothetical protein  34.48 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 79 aa  43.5  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 262 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.16 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 464 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>