75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6836 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  64.23 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  63.2 
 
 		 133 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  54.03 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  47.41 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  51.24 
 
 		 131 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 137 aa  98.2  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 144 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  59.72 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  53.62 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 79 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 70 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  39.25 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.83 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.38 
 
 		 119 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 115 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 115 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 327 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 489 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 495 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 90 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0309  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0189461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 97 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  31.25 
 
 		 81 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 142 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 180 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 93 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 85 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  36.36 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 72 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>