More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2086 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 327 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.27 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  22.82 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.63 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  19.42 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  22.34 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  23.78 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  19.16 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  49.12 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  21.35 
 
 		 844 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  21.98 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  19.47 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  19.47 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.12 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  20.72 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  22.67 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  20.41 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  21.84 
 
 		 745 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  20.55 
 
 		 825 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  20.09 
 
 		 825 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  20.09 
 
 		 825 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  20.09 
 
 		 825 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  20.09 
 
 		 825 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 163 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  20.63 
 
 		 872 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 		 872 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  22.45 
 
 		 866 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  16.82 
 
 		 776 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  21.79 
 
 		 949 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  24.2 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  23.35 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 196 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  19.48 
 
 		 567 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 976 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  19.72 
 
 		 825 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  21.25 
 
 		 600 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  23.6 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  19.63 
 
 		 862 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  23.76 
 
 		 846 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  19.66 
 
 		 452 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  23.27 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 		 521 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  21.47 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  24.41 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.74 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  22.84 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  23.6 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  17.12 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  22.06 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.01 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 		 710 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  22.16 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  24.16 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  17.3 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  21.78 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  22.67 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.67 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  22.46 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  17.41 
 
 		 862 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  23.19 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.67 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  21.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  21.01 
 
 		 727 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  24.34 
 
 		 870 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  24.09 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 		 515 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  29.81 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  21.39 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  18.79 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  23.38 
 
 		 199 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  19.66 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 151 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4564  hypothetical protein  24.71 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  22.16 
 
 		 493 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  19.63 
 
 		 877 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  21.39 
 
 		 881 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>