More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0584 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  68.01 
 
 		 503 aa  674    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  87.07 
 
 		 504 aa  905    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  100 
 
 		 495 aa  1032    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  61.02 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  60.3 
 
 		 504 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  58.63 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.41 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  56.42 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  57.77 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  56.04 
 
 		 488 aa  578  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  55.37 
 
 		 489 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  54.53 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  53.97 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  52.09 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  55.46 
 
 		 486 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  25.87 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  23.37 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  25.62 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  22.88 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  24.34 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  23.24 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  23.62 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  22.88 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.18 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  22.62 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  25.73 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  24.43 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  22.47 
 
 		 511 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  37.97 
 
 		 369 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  21.48 
 
 		 518 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  44.74 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  49.23 
 
 		 215 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  23.24 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3044  XRE family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 513 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.439446  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 211 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  24.03 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  23.83 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  22.22 
 
 		 503 aa  53.9  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  27.92 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 201 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 433 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 196 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 194 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  36.99 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 209 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  23.7 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 		 208 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 201 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  38.37 
 
 		 202 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 188 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 192 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  38.37 
 
 		 202 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  38.37 
 
 		 202 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  38.37 
 
 		 202 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 201 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 201 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 201 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  34.67 
 
 		 207 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 253 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 128 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  23.63 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 321 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 110 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 374 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>