58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0302 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  69.78 
 
 		 511 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 510 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  70.38 
 
 		 509 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 518 aa  1087    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 504 aa  715    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 510 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 509 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  66.8 
 
 		 505 aa  707    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 508 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  70.58 
 
 		 510 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 510 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 510 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 510 aa  750    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 511 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  70.38 
 
 		 509 aa  756    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  68.79 
 
 		 508 aa  739    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3044  XRE family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 513 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.439446  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  65.21 
 
 		 504 aa  694    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  70.58 
 
 		 510 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  69.76 
 
 		 503 aa  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000799  predicted transcriptional regulator  66.37 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06696  hypothetical protein  66.37 
 
 		 467 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1175  hypothetical protein  78.26 
 
 		 62 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  22.67 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  22.54 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  21.67 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  22.86 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  21.48 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  23.71 
 
 		 504 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  20.85 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  21.46 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  23.49 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 191 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 105 aa  47  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.14 
 
 		 200 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  20.49 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  20.84 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  22.77 
 
 		 486 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 199 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 199 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  20.36 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 193 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 188 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>