More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1864 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  74.69 
 
 		 478 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  73.53 
 
 		 481 aa  738    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  83.64 
 
 		 489 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  71.84 
 
 		 490 aa  744    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  1006    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  56.72 
 
 		 495 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  57.38 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 		 503 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  55.39 
 
 		 504 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  51.15 
 
 		 505 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  51.15 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  50.11 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  49.48 
 
 		 488 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  49.06 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  50.52 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  26.93 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  28.95 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  28.79 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  26.41 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  24.67 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 476 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  24.53 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  24.59 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  26.06 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  26.02 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  25.52 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  24.51 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  24.73 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  24.5 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  23.04 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  55.22 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  23.53 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  43.06 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  25.76 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 194 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  24.87 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  25.6 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  24.89 
 
 		 464 aa  57  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 191 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  22.41 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 194 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  23.23 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  49.21 
 
 		 191 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  49.21 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 137 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 195 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 189 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 197 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  23.04 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 511 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 96 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>