171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1557 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
470 aa  951    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  67.73 
 
 
469 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
470 aa  951    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  95.32 
 
 
483 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  65.54 
 
 
474 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  66.03 
 
 
470 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  65.39 
 
 
469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  65.33 
 
 
469 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
480 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
481 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  40.08 
 
 
480 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  43.43 
 
 
481 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  39.03 
 
 
480 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 
482 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  39.54 
 
 
488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  38.99 
 
 
483 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 
483 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  38.41 
 
 
476 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 
464 aa  289  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
483 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  37.34 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  37.12 
 
 
477 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  39.3 
 
 
476 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  36.91 
 
 
477 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  36.02 
 
 
474 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  38.15 
 
 
477 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  37.42 
 
 
474 aa  273  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.78 
 
 
467 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.29 
 
 
468 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  35.67 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  38.95 
 
 
469 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
471 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 
470 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  34.56 
 
 
491 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  35.19 
 
 
470 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
479 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  36.13 
 
 
490 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  34.62 
 
 
470 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  35.11 
 
 
475 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  34.41 
 
 
472 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  33.76 
 
 
464 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  34.82 
 
 
475 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  34.82 
 
 
475 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  34.82 
 
 
475 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  33.91 
 
 
475 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  34.31 
 
 
482 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  34.96 
 
 
461 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  34.11 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  34.33 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 
475 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
461 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  34.32 
 
 
461 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  37.55 
 
 
461 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 
466 aa  242  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 
463 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  34.65 
 
 
490 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  32.7 
 
 
466 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 
474 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  38.33 
 
 
484 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
473 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  34.74 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 
506 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  34.65 
 
 
490 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  33.12 
 
 
474 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  36.3 
 
 
464 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  34.56 
 
 
491 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  33.05 
 
 
486 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  32.28 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  34.58 
 
 
461 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  34.76 
 
 
471 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  31.56 
 
 
474 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  36.22 
 
 
455 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
495 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.77 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.08 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  35.94 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  26.44 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  24.58 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  24.67 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 
440 aa  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  24.57 
 
 
488 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.23 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  25.26 
 
 
503 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 
490 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 
504 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  49.33 
 
 
191 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 
197 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 
195 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 
201 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
197 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 
191 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 
199 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 
197 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  37.14 
 
 
107 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>