112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2998 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 474 aa  961    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  49.79 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  49.47 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  49.68 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  48.82 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  48.09 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  47.97 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  47.75 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  46.62 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  47 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  41.51 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  41.3 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  41.24 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  42.49 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  45.25 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  44.26 
 
 		 524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.35 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 474 aa  340  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  41.15 
 
 		 466 aa  339  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  40.38 
 
 		 475 aa  333  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  43.64 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  41.89 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  41.99 
 
 		 477 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  41.99 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  40.84 
 
 		 475 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  41.29 
 
 		 476 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  41.47 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  38.61 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  39.96 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  38.98 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  37.34 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  41.01 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  38.59 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 468 aa  283  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 476 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.73 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.19 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  37.53 
 
 		 479 aa  256  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  36.56 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  34.96 
 
 		 483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  34.32 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 491 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  35.7 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  35.92 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  47.76 
 
 		 149 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  26.58 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  21.26 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  21.37 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  24.02 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  24.1 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  29.46 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 180 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 180 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>