199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0594 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  978    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 480 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  50.32 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  50.11 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 483 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  50.21 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  49.79 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  48.51 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  45.17 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  46.2 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  44.4 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  47.16 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  43.91 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  42 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  43.78 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  44.54 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  40.04 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  42.53 
 
 		 482 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  41.95 
 
 		 475 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 469 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 477 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  43.87 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  40.38 
 
 		 472 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  42.59 
 
 		 475 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  42.59 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  39.45 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  40.13 
 
 		 475 aa  353  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  45.36 
 
 		 461 aa  349  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 469 aa  349  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  41.39 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 461 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  41.39 
 
 		 461 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  39.66 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  43.01 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  41.6 
 
 		 474 aa  339  8e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  41.74 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  44.63 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 474 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  39.07 
 
 		 477 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  43.51 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 475 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 491 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  41.68 
 
 		 469 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  41.47 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  38.78 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  41.52 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 495 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  51.88 
 
 		 149 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.81 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  25.79 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  22.54 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  26 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  20.93 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  26.52 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  25.83 
 
 		 504 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  21.05 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  26.28 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>