167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5864 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 470 aa  957    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  65.04 
 
 		 524 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  60.21 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 490 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  60.08 
 
 		 490 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  57.3 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  52.34 
 
 		 475 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  50.43 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  50.63 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  50.64 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  50.53 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  49.17 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  51.06 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  49.69 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  49.69 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  52.12 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  48.31 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  50.34 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  50.92 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  43.51 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  45.13 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  41.56 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  42 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  41.35 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  45.13 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  40.81 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  43.16 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  45.01 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  45.01 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  42.95 
 
 		 477 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 470 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  43.34 
 
 		 481 aa  355  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  40.81 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 482 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.52 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  41.13 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  43.74 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  40.17 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  42.32 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  42.43 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.17 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.63 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.41 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  39.03 
 
 		 479 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  38.12 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 474 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  35.67 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  36.48 
 
 		 470 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  34.53 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  45.6 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  27.89 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  25.77 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  25.59 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.28 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  22.27 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  25.05 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  22.27 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  23.28 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  24.5 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  25.35 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25.17 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>