270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2489 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  74.69 
 
 		 490 aa  758    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  75.79 
 
 		 481 aa  766    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 478 aa  983    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  74.21 
 
 		 490 aa  754    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  74.48 
 
 		 489 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  57.59 
 
 		 504 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  56.42 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  54.01 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  55.27 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  54.14 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  50.84 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  49.48 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  50.11 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  49.58 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  51.98 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  28.04 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  25.43 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  24.78 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  25.37 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  25.19 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  24.53 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  24.88 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  24.41 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  24.05 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  24.88 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  22.93 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  24.07 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  24.84 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  24.22 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  23.31 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  24.48 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  22.71 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  24.62 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  23.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  23.64 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  49.32 
 
 		 192 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  25.85 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  25.07 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 197 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.25 
 
 		 114 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  36.25 
 
 		 114 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 189 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  49.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  23.45 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  22.66 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 211 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 110 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 219 aa  53.5  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 200 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 194 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35.21 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  51.2  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  25.98 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 202 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 505 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 199 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>