100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3695 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  777    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  777    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  32.28 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.76 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  29.72 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  27.11 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.53 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  33.76 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  30.31 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  27.4 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  26.68 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  28.36 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  27.75 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  37.41 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  33.07 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 474 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  29.93 
 
 		 562 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  32.12 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  38.71 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 113 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 495 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.05 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  33.78 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.79 
 
 		 481 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  34.38 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 175 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  32.81 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 469 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  29.57 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  32.79 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 106 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1046  putative DNA-binding protein  37.65 
 
 		 87 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.32421  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  35.94 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 130 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  36.62 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  40.28 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  33 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 131 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  24.58 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  38.71 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  39.71 
 
 		 489 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  31.58 
 
 		 527 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>