More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3450 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 489 aa  1002    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  74.48 
 
 		 478 aa  753    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  74.29 
 
 		 490 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  74.58 
 
 		 481 aa  743    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  83.64 
 
 		 490 aa  863    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  55.37 
 
 		 495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  56.03 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  54.03 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  52.58 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  51.69 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  49.69 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  50.21 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  49.68 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  48.1 
 
 		 488 aa  465  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  47.89 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  49.16 
 
 		 486 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25.44 
 
 		 484 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  29.77 
 
 		 469 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  27.74 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  24.95 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  25.05 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  24.23 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  24.89 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  25.39 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  25.38 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  25.4 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  25.64 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  25.11 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  22.78 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  22.61 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  25.06 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  25.67 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  25.3 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  25.75 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 200 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.63 
 
 		 114 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35.63 
 
 		 114 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 194 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  22.34 
 
 		 474 aa  57  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 194 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.37 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  23.78 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  26.63 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  25.37 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  23.18 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  24.79 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 207 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.89 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 137 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 232 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 192 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 96 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  22.96 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 509 aa  53.5  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 199 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 195 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  24.12 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>