More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_02070 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 488 aa  990    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  56.04 
 
 		 495 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 504 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  55.96 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  55.01 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  53.67 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.69 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 490 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  50.42 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  50.11 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  52.63 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  49.68 
 
 		 489 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  49.17 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  51.48 
 
 		 486 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.79 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  25.74 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  25.96 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  24.65 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  27.97 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  24.25 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  22.37 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  25.05 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  22.15 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25.18 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  24.37 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  29.85 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 464 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  45.78 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  24.49 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  22.06 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  27.23 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  29.1 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  38.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  22.54 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 470 aa  57  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 200 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2386  transcriptional regulator, XRE family  38.52 
 
 		 159 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 201 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  38.67 
 
 		 107 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 255 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 107 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 107 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 105 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 211 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 511 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 179 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 194 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  24.06 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  43.33 
 
 		 72 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 516 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  35.71 
 
 		 200 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  45 
 
 		 192 aa  53.5  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.78 
 
 		 189 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.89 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>