More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1430 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  74.29 
 
 		 489 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  84.34 
 
 		 481 aa  842    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 490 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  74.21 
 
 		 478 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 490 aa  1014    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  58.04 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  57.77 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  54.97 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  53.72 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  52.31 
 
 		 489 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  50.31 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  50.94 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  50.42 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  50.63 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  28.35 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  24.42 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  24.49 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  25.06 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  24.78 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 481 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  22.75 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  22.77 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  24.16 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  22.83 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  23.09 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  25.87 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  25.96 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  24.4 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  22.12 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  24.81 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  24.33 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  24.12 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.24 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  50.75 
 
 		 195 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  22.48 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  22.19 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  45.57 
 
 		 215 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  35 
 
 		 114 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  35 
 
 		 114 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 476 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 200 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 192 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  24.12 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  44.87 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 209 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 202 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 189 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  24.59 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  35 
 
 		 114 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  24.07 
 
 		 474 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40.62 
 
 		 200 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  41.56 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 117 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 110 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  21.96 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 194 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 171 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 223 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 192 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 163 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  24.89 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 192 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  24.72 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>