167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1626 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  962    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  43.64 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  46.17 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  43.07 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  42.58 
 
 		 477 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 474 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  40.22 
 
 		 476 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  43.28 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  41.15 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  42.28 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  43.79 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  40.51 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  41 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  38.97 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  38.53 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  40.09 
 
 		 466 aa  305  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  38.32 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  39.78 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  38.4 
 
 		 475 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 463 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  40.25 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  39.03 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  40.34 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 490 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 464 aa  299  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  37.69 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  42.95 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 479 aa  296  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  39.29 
 
 		 474 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  39.19 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  37.58 
 
 		 466 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 473 aa  279  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  40.87 
 
 		 469 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  39.4 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  36.09 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  39.41 
 
 		 464 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  38.5 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  38.68 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 462 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  40.83 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  35.76 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 149 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.36 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  26.94 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  26.11 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  25.5 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  25.6 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  23.2 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  24.4 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  24.21 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25.18 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  24.06 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  22.25 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  22.25 
 
 		 504 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  41.86 
 
 		 224 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>