More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5338 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  67.71 
 
 		 504 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 503 aa  1040    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  67.36 
 
 		 495 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  61.18 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  58.05 
 
 		 505 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  58.17 
 
 		 504 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 490 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  56.48 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  55.53 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  54.01 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  54.08 
 
 		 490 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  54.03 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  52.07 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  51.65 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  52.93 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  24.94 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  26.91 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  25.39 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  23.88 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  24.15 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25.8 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  25.84 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  23.11 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 464 aa  62  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  25.73 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  23.88 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.66 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  25.55 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  24.25 
 
 		 496 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  24.04 
 
 		 475 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 195 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  24.12 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  24.29 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  23.18 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 192 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  23.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 191 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 462 aa  54.3  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 211 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 118 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  22.87 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 202 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 227 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  35.85 
 
 		 209 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  24.4 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 227 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  24.48 
 
 		 505 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  25.79 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 193 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  23.46 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 201 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 281 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 189 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  26.07 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 192 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 480 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 192 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 195 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3888  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  28.31 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 223 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 81 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  24.78 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 81 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 227 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>