141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4449 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1071    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  66.81 
 
 
490 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  65.04 
 
 
470 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  64.89 
 
 
490 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  62.92 
 
 
474 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  64.27 
 
 
490 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  61.02 
 
 
474 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  58.51 
 
 
471 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  54.03 
 
 
475 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  53.86 
 
 
475 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  59.19 
 
 
461 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  53.94 
 
 
482 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  52.53 
 
 
474 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  53.47 
 
 
466 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  51.58 
 
 
475 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  51.58 
 
 
475 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  51.58 
 
 
475 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  53.4 
 
 
486 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  50.84 
 
 
475 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  52.87 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  51.24 
 
 
471 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  49.78 
 
 
461 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  51.96 
 
 
455 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 
491 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  45.05 
 
 
464 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  44.63 
 
 
477 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 
469 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  43.91 
 
 
481 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
474 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  43.22 
 
 
474 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  40.76 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 
483 aa  355  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 
481 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  41.49 
 
 
477 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  40.98 
 
 
472 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  41.35 
 
 
472 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  40.98 
 
 
470 aa  352  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  41.23 
 
 
480 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  41.63 
 
 
461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  41.84 
 
 
461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 
477 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  42.04 
 
 
476 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  41.14 
 
 
483 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 
477 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  41.28 
 
 
488 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.17 
 
 
480 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  42.43 
 
 
473 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  40.88 
 
 
480 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 
483 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  42.8 
 
 
484 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  39.75 
 
 
482 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  41.01 
 
 
464 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  43.31 
 
 
477 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.62 
 
 
468 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  43.79 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  41.79 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  40.99 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 
495 aa  289  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.94 
 
 
475 aa  287  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  36.63 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 
464 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  38.48 
 
 
472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 
491 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35.31 
 
 
474 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  34.89 
 
 
483 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  34.74 
 
 
470 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  34.74 
 
 
470 aa  251  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  34.81 
 
 
470 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.5 
 
 
469 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
463 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 
469 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 
469 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  36.69 
 
 
462 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  47.79 
 
 
149 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  26.92 
 
 
431 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 
443 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  28.3 
 
 
428 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  24.69 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  23.64 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  27.79 
 
 
428 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  26.2 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  22.13 
 
 
491 aa  64.7  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  24.93 
 
 
504 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  23.97 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  23.27 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
180 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.07 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 
433 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25.12 
 
 
513 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
175 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>