113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01702 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  100 
 
 		 461 aa  926    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  65.66 
 
 		 455 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 474 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  48.23 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  49.78 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  50.68 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  49.13 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  45.15 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  45.51 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  44.16 
 
 		 482 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  43.71 
 
 		 466 aa  355  7.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  43.64 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  43.64 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  45.83 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  45.72 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  41.96 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  40.58 
 
 		 472 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  40.13 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  41.02 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  42.25 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 480 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  41.29 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 477 aa  299  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  40.58 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 483 aa  296  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  39.91 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  40.49 
 
 		 480 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  40.13 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 477 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  39.48 
 
 		 466 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  37.53 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  40.94 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  40.67 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  40.67 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  41.09 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 477 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  43.33 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 476 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 506 aa  266  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.35 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  39.61 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 495 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.23 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  38.15 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.06 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 474 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  34.55 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 491 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  33.48 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 462 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  33.26 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  42.5 
 
 		 149 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  26.21 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  27.59 
 
 		 488 aa  87  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  26.78 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  24.59 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  26.89 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  24.62 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  24.5 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  23.64 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.03 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  27.51 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.4 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>