93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2696 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 440 aa  862    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  40.73 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 428 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.48 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  27.16 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  27.45 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  25.87 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  28.09 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  28.87 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  24.73 
 
 		 482 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  26.29 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 490 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 470 aa  87  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  24.95 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  23.21 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  25.75 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  25.54 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  25.55 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  25.36 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  25.92 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  25.32 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  25.97 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  24.03 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  26.22 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  25.56 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  23.13 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  25.22 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  24.38 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 506 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  35.26 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  24.41 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  44.07 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  44.07 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  23.78 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  37.18 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 490 aa  53.9  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  44.26 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  29.37 
 
 		 474 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  27.32 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 115 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 76 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  24.66 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 138 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  36.23 
 
 		 216 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  36.23 
 
 		 216 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 139 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 138 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 112 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  35.48 
 
 		 209 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 139 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>