220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2962 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  82.69 
 
 		 477 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  83.4 
 
 		 477 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  962    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  83.4 
 
 		 477 aa  811    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  54.91 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  48.37 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  44.37 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  41.85 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  40.56 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  46.04 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  41.29 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  42.74 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  41.36 
 
 		 474 aa  349  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  42.05 
 
 		 524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  39.57 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  38.92 
 
 		 470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  38.92 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  41.67 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  40 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  40.69 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  38.81 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.17 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  39.07 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  39.07 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  38.94 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  38.63 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  40.63 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  42.15 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 476 aa  312  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 474 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  38.9 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  37.84 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  38.92 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  38.63 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  37.74 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  39.86 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  37.77 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  38.28 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 469 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 491 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  45.19 
 
 		 149 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 428 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  27.76 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.8 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  25.37 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.68 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  24.46 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  29.85 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  24.51 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25.7 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  29.65 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 504 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.94 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 513 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 510 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>