114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0218 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 455 aa  918    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  64.68 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 471 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  50.11 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  52.69 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  51.95 
 
 		 524 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  51.45 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  47.77 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  45.49 
 
 		 486 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  46.04 
 
 		 474 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 474 aa  358  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  45.88 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  45.35 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  45.35 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  42.48 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  44.42 
 
 		 482 aa  345  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  45.5 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  41.81 
 
 		 477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  41.56 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  38.19 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  38.41 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  39.24 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 483 aa  299  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  39.07 
 
 		 477 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 477 aa  296  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  38.9 
 
 		 480 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  40.09 
 
 		 476 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 		 480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  39.78 
 
 		 464 aa  282  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  41.78 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  36.66 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  39.65 
 
 		 474 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.8 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  38.48 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  38.26 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  39.65 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  38.62 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  35.63 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 495 aa  236  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.48 
 
 		 475 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  35.79 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  35.03 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 149 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  27.87 
 
 		 513 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  25.06 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  26.26 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  24.85 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  23.73 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  28.14 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  22.41 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  19.79 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.16 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  21.9 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  21.79 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 78 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  21.3 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>