253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0387 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  70.42 
 
 		 489 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 486 aa  972    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  67.69 
 
 		 513 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  64.35 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  55.46 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  56.55 
 
 		 488 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  54.81 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  52.93 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  51.98 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.67 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  50.63 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  51.24 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  51.48 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  49.16 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  27.32 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  26.46 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  30.62 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  26.11 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  24.83 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  26.58 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  22.77 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.58 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 199 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.52 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 93 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  26.48 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 178 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  46.03 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 96 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 117 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 207 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 276 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 198 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  22.37 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 433 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 195 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2282  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 89 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  28.82 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  23.42 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  23.5 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 201 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 182 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 200 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 204 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 210 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 84 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 182 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  43.55 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 195 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 221 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 187 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>