More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4036 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4035  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  47.22 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 192 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 371 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  38.89 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 504 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  39.71 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 374 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  36.36 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  39.19 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>