More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0025 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 183 aa  363  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  79.81 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 191 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  57.81 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  58.33 
 
 		 141 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  59.62 
 
 		 145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  59.63 
 
 		 128 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  57.14 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  55.77 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  57.28 
 
 		 128 aa  118  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  55.45 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  52.63 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50.88 
 
 		 72 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  49.12 
 
 		 115 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 104 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  47.27 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 101 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  43.64 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  32.31 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.08 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 71 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 71 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 112 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>