More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3995 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  50.75 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  56.67 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  47.76 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 390 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  43.59 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.07 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.58 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  32.94 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  37.31 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  32.35 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  32.1 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  33.75 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  44.26 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  44.26 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  35.06 
 
 		 181 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  27 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.67 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>