More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2573 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 77 aa  156  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  69.44 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  69.44 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  48.57 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  53.33 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  55.74 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  41.98 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  41.43 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  42.17 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  42.42 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  45.31 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 112 aa  57  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.98 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40.91 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.03 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  39.34 
 
 		 421 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  39.34 
 
 		 421 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>