More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0455 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  53.42 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  53.42 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  50.68 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  52.31 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  53.33 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  51.61 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  43.75 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  48.44 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  45.45 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  56 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 57 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  38.71 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  38.71 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  57.45 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  51.79 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  39.47 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.98 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  45.9 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>