297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0645 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 74 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  55.74 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  49.21 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 390 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  44.78 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  48.33 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  44.78 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  52.46 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  46.03 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  44.29 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  46.55 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  41.94 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 66 aa  50.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  56.25 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  56.25 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>