More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0577 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  79.71 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 76 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  65.28 
 
 		 72 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  64.71 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  59.42 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.18 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  42.42 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  50.79 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  50.79 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  40.91 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  40.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  40.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  40.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  41.67 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  43.33 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  38.36 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  33.85 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>